| MirGeneDB ID | Mml-Mir-3145 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3145 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-3145 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cja-Mir-3145 Hsa-Mir-3145 Pab-Mir-3145 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014339.1: 42059194-42059255 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AUUUUGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGAAAGGAAAAAAUGUAUUCAUAUAAGGUCAACUCCAAACAUUCAAAACGCAUUGUUGAAUGGAAUUAGGUAUUUUGAGUGUUUGGAAUUGAACUUGUAUGCACUGAUACACCAAUACCAGUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGAAAGGAAAAAAUGUAUU--| G C CG AUUGUUGA CAUAUAAG UCAA UCCAAACAUUCAAAA C A GUAUGUUC AGUU AGGUUUGUGAGUUUU G U UGACCAUAACCACAUAGUCAC^ A A AU GAUUAAGG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | Because of a secondary structural difference between human and macaque the major form of the mature 3p arm is shifted -3 relative to human | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mml-Mir-3145_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0027120 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AACUCCAAACAUUCAAAACGCAU -23
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-3145-5p |
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| Mature sequence | Mml-Mir-3145_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0024349 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UAUUUUGAGUGUUUGGAAUUGA -62
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-3145-3p |
