| MirGeneDB ID | Gsa-Mir-9391 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-9391 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Russian doll killer (Gyrodactylus salaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | gsa-mir-9391 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | G. salaris | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | G. salaris | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (gyrodactylus_salaris.PRJNA244375.WBPS19.genomic) |
scf7180006953254: 15392-15469 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCCAUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCUUGUCGCUCAGUAUGUCUUGAAUUGUUGAUCCAUGUUUUAGAAAAUGGUGGAUUAUUGAUUUUUAUUUGGAUAAUUUCACCACCGUUGUCUGUGAACAUGUGUAAACUUUGGAGAUCAAACGUCUUUGAAAAAAAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 GCUUGUCGCUCAGUAUG----| G UU G UC - A AUUAUUGAUUUUU UCUU AA GUU A CAUGUUU UAGA AAUGGUGG A AGAG UU CAA U GUACAAG GUCU UUGCCACC U AAAAAAAAGUUUCUGCAAACU^ G U- A GU U G ACUUUAAUAGGUU 130 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Gsa-Mir-9391_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0035326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUCCAUGUUUUAGAAAAUGGUGG -23
Get sequence
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| Star sequence | Gsa-Mir-9391_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0035327 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
53- ACCGUUGUCUGUGAACAUGUGUAAA -78
Get sequence
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