MirGeneDB ID | Esc-Mir-12507 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-12507 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Hawaiian bobtail squid (Euprymna scolopes) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Npo-Mir-12507 Obi-Mir-12507 Ovu-Mir-12507 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Cephalopoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Cephalopoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (esc-GCA_024364805.1_ASM2436480v1) |
CM044506.1: 69015405-69015465 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGGCGGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUGGUGCCUAGCGACCAGCACUGCAGGGGUGGUGGGCAACAAUUCCACCAGGACUGUCCGUCCUUCAUCCUGGCGGAUUUGAUGCCACGGCAAAUGCAGGUGCUCCAGGAGCUGGAAAAGGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 GUGGUGCCUAGCGACCA- -| GGG G G A U A CUGUCC GCA CUGCA GU GUGG CA CAA UCC CCAGGA G CGU GACGU CG CACC GU GUU AGG GGUCCU U GGAAAAGGUCGAGGACCU G^ AAA G - A U C ACUUCC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Esc-Mir-12507_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GGUGGGCAACAAUUCCACCAGGA -23
Get sequence
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Mature sequence | Esc-Mir-12507_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- CUGGCGGAUUUGAUGCCACGGC -61
Get sequence
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