MirGeneDB ID | Emu-Mir-2015 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2015 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Muellers freshwater sponge (Ephydatia muelleri) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aqu-Mir-2015 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Demospongiae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Demospongiae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_013339895_Emu) |
JABACO010000002.1: 17506160-17506226 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAUGUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUGGCGACAUGGAUAAAGAGCAGUGUCUUGUCAUGUAUUGUGGAGGGGAGAGGGUCAAAUGUGGCCACACUUCCUCUCCUCUUCAUAAUGCAUGCCAAGGCCUUCUUUUGACAUCCGGCAGCUCACAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 UUGGCGACAUGGAUAAA---| C U U GGGUCAAAUGU GAG AG GUCUUG CAUGUAUUGUGGAGGGGAGA \ UUC UC CGGAAC GUACGUAAUACUUCUCCUCU G ACACUCGACGGCCUACAGUU^ U - C CCUUCACACCG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Emu-Mir-2015_5p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCAUGUAUUGUGGAGGGGAGA -21
Get sequence
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Star sequence | Emu-Mir-2015_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
46- UCCUCUUCAUAAUGCAUGCCA -67
Get sequence
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