MirGeneDB ID | Ebu-Mir-130-P1g | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-130 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Inshore hagfish (Eptatretus burgeri) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Ebu-Mir-130-P1e Ebu-Mir-130-P1f Ebu-Mir-130-P2e Ebu-Mir-130-P4e | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | E. burgeri | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Eburgeri_3) |
FYBX02010190.1: 8151303-8151362 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AGUGCAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCCUUGUUUUUCCAACUUCCACGUGCCUGUGCCCUUUUCUUGUUGCACGGCUGUUAUUUCUGUACAAGUAGUGCAAUUUGAAAAGGGCAUCGGAAUGUGGAGCCAUCACACUGUGUGCGUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UCCUUGUUUUUCCAACU--| G U UU G GUUAUU UCCACGU CC GUGCCCUUUUC GUUGCAC GCU U AGGUGUA GG UACGGGAAAAG UAACGUG UGA C UGCGUGUGUCACACUACCG^ A C UU A ACAUGU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Ebu-Mir-130-P1g_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GCCCUUUUCUUGUUGCACGGCU -22
Get sequence
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Mature sequence | Ebu-Mir-130-P1g_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UAGUGCAAUUUGAAAAGGGCAU -60
Get sequence
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