| MirGeneDB ID | Dsi-Mir-967 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-967 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dsi-mir-967 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dme-Mir-967 Dya-Mir-967 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
2L: 12077715-12077791 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGAUAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAACUGAGAACUGCAGGAGACUUGGAGAGCAGAGAUACCUCCGGAGAAGCGCGUGACCUGACCCCAGCAGGAGAACCCAACCCGCUUUUCCGCCUAGGUGUCUCUCUCUCUCUCUCACUCUAUCUCAGUUCCUCAGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AAACUGAGAACUGCAGGA--- CUU C C--| CGUGACCUGACCCCA GA GGAGAG AGAGAUACCU CGGAGAAGCG \ CU UCUCUC UCUCUGUGGA GCCUUUUCGC G CGACUCCUUGACUCUAUCUCA CUC - UCC^ CCAACCCAAGAGGAC 130 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dsi-Mir-967_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0012437 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGAGAUACCUCCGGAGAAGCG -21
Get sequence
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| Star sequence | Dsi-Mir-967_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0012438 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
54- CUUUUCCGCCUAGGUGUCUCUCU -77
Get sequence
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