| MirGeneDB ID | Dme-Mir-1003 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1003 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-1003 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dan-Mir-1003 Dmo-Mir-1003 Dsi-Mir-1003 Dya-Mir-1003 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
3R: 24658605-24658660 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUCACAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCGCGAACUGGCCCUCAAGCUGCGCAGAAGGUGGGUAUCUGGAUGUGGUUGGCUCUGGCGGUCCUCUCACAUUUACAUAUUCACAGGCGCCGUGAGCUGCGUCACAAAUAUGGAACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GCGCGAACUGGCCCUCA- ----| AGAAG C UU CUCU AGCU GCGC GUGGGUAU UGGAUGUGG GG G UCGA CGCG CACUUAUA AUUUACACU CC G CAAGGUAUAAACACUGCG GUGC^ GA--- C CU UGGC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dme-Mir-1003_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020902 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUGGGUAUCUGGAUGUGGUUGG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dme-Mir-1003_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0005016 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- UCUCACAUUUACAUAUUCACAG -56
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005016 TargetScanFly: dme-miR-1003 |
