MirGeneDB ID | Dlo-Mir-927-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-927 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Braconid wasp (Diachasmimorpha longicaudata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dlo-Mir-927-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-927-P2 Aga-Mir-927-P2 Bge-Mir-927-P2-v1 Hme-Mir-927-P2 Tca-Mir-927-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_034640455.1_iyDiaLong2_genomic) |
NC_087242.1: 3742959-3743022 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUUAGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGAUGAAGAAAAAAUAUGCCAAGACACUUGUUUUAGAAUUAGUACGCUCUGCUGUCUGGGAAAUUAUGUCACAGAGCAUGCUGAUUCUUCAGCAUGUAGCACUGGCGACAUACAUCAAUGAUGUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 UGAUGAAGAAAAAAUAU- AGAC-| U UU C CUGUCUGGG GCCA AC UGUU AGAAUUAGUA GCUCUG A CGGU UG ACGA UCUUAGUCGU CGAGAC A UGUAGUAACUACAUACAG CACGA^ U CU A ACUGUAUUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dlo-Mir-927-P2_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUUUAGAAUUAGUACGCUCUGC -22
Get sequence
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Star sequence | Dlo-Mir-927-P2_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
42- AGAGCAUGCUGAUUCUUCAGCA -64
Get sequence
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