MirGeneDB ID | Cte-Mir-2689 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2689 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Polychaete worm (Capitella teleta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cte-mir-2689 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Efe-Mir-2689-P1 Efe-Mir-2689-P2 Pdu-Mir-2689 Snu-Mir-2689 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Sipuncula + Pleistoannelida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Sipuncula + Pleistoannelida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Capitella_teleta_v1.0) |
CAPTEscaffold_339: 64468-64526 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUCCUGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAACGCUACUUGAAUUGUCGUUUCCGAAUCAGGCCUCGCUGGCCAGGAUUCGGGCUUAUUUCCUCGUAUCCUGGCCUGCAAGUGCACUCAUUCGGACGACCUUAUCUCCAUGGCAACAGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 AAACGCUACUUGAAUUG---| UU C - - C U U GGCUU UCG UCCGAAU AG GC CU GC GGCCAGGAU CG A AGC AGGCUUA UC CG GA CG CCGGUCCUA GC U GACAACGGUACCUCUAUUCC^ -- C A U A U U UCCUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cte-Mir-2689_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGGCCUCGCUGGCCAGGAUUCG -22
Get sequence
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Mature sequence | Cte-Mir-2689_3p |
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mirBase accession | MIMAT0013542 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- UAUCCUGGCCUGCAAGUGCACUC -59
Get sequence
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