MirGeneDB ID | Cpi-Mir-9592 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-9592 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Western painted turtle (Chrysemys picta bellii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cpi-mir-9592 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | C. picta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | C. picta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (chrPic1) |
JH584868: 1390555-1390614 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACCUUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUUUUUGUGCACAAGGAGUCUGAUCCUGCUGACCUUAUUCAGACAAAGCUCUUUUUGAUUCCAGUAGGAUUUUGCCUGAGUAGGGACUGCAGGGUUUGGCCCACAAGCAGUCGAUGCUGUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CUUUUUGUGCACAAGGA---| U UGA A CU UUUUGA GUC GAUCCUGC CCUUAUUCAG CAAAG CU \ CGG UUGGGACG GGGAUGAGUC GUUUU GA U UGUCGUAGCUGACGAACACC^ U UCA C AG UGACCU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Cpi-Mir-9592_5p |
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mirBase accession | MIMAT0037980 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GACCUUAUUCAGACAAAGCUCU -22
Get sequence
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Co-mature sequence | Cpi-Mir-9592_3p |
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mirBase accession | MIMAT0037981 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- AUUUUGCCUGAGUAGGGACUGC -60
Get sequence
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