MirGeneDB ID | Cpi-Mir-9584 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-9584 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Western painted turtle (Chrysemys picta bellii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cpi-mir-9584 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | C. picta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | C. picta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (chrPic1) |
JH584684: 2537512-2537569 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGUGACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGUGUUGUGAGCCUGGAACCAUCUAGAGAGCUGUGACUGUUUAGAUGGUCGUGUGGGGUAUGCGCACACAGCCUCAGCAGUCACUGCUUUUUAGAUGUUUCUCUGUUAUGGCAUCAUUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GGUGUUGUGAGCCUGGAAC--| U UA U C UGGGGU CAUCUAGAGAGC GUGACUGUU GA GGU GUG \ GUAGAUUUUUCG CACUGACGA CU CCG CAC A UUACUACGGUAUUGUCUCUUU^ U -- - A ACGCGU 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Cpi-Mir-9584_5p |
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mirBase accession | MIMAT0037964 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUGUGACUGUUUAGAUGGUCGUG -23
Get sequence
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Co-mature sequence | Cpi-Mir-9584_3p |
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mirBase accession | MIMAT0037965 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- CAGCCUCAGCAGUCACUGCU -58
Get sequence
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