MirGeneDB ID | Cli-Mir-9633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-9633 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rock pigeon (Columba livia) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cli-mir-9633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | C. livia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | C. livia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (colLiv2) |
scaffold87: 761143-761206 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GAGGAUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GCCUGGCAGCAGCUCCGGGGCUCCACAUGCAGAGGAUGGAGCUGAAUGGGAUUUUGCUGCCUGAAAUGGUCCCAUCCAGCCCCAGUCCUGCUGCACGGGGAGGCAGAUGAGUGUGUGCUUGCCUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 GCCUGGCAGCAGCUCCGGGG-- ACA - -| A A UUUUGCUG CUCC UGCAG AGGA UGG GCUG AUGGGA C GAGG ACGUC UCCU ACC CGAC UACCCU C UCCGUUCGUGUGUGAGUAGACG GGC G G^ C C GGUAAAGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Cli-Mir-9633_5p |
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mirBase accession | MIMAT0038757 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGAGGAUGGAGCUGAAUGGGA -21
Get sequence
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Star sequence | Cli-Mir-9633_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0038758 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
41- CCAUCCAGCCCCAGUCCUGCUGC -64
Get sequence
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