| MirGeneDB ID | Cja-Mir-887 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-887 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | White-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Hsa-Mir-887 Mml-Mir-887 Pab-Mir-887 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Simiiformes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_011100555.2_mCalJa1.2.pat.X_genomic) |
CM021916.1: 186031565-186031629 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGAACGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGACAUCAUCAGAGAGCCCUGGGGUGCAGAACCUUGGGAGCCCUGUUAGACUCUGGAUUUUAAACUUGGAGUGAACGGGCGCCAUCCCGAGGCUUUGCAUAGGGGCAUGCUUCGAAUUCCAUUUUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGACAUCAUCAGAGAGC--- GGG A -- -| AG UGGAUUU CCU GUGCAGA CCUUGGGA GC CCUGUU ACUC \ GGG UACGUUU GGAGCCCU CG GGGCAA UGAG U UUUUACCUUAAGCUUCGUAC GA- C AC C^ G- GUUCAAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cja-Mir-887_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACCUUGGGAGCCCUGUUAGACUC -23
Get sequence
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| Mature sequence | Cja-Mir-887_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- GUGAACGGGCGCCAUCCCGAGGCUU -65
Get sequence
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