| MirGeneDB ID | Cel-Mir-792 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-792 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cel-mir-792 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | C. elegans | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (ce11) |
chrV: 3042105-3042166 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-792) |
Mir-792
chrV: 3042105-3042166 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-1821 chrV: 3042552-3042613 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | UGAAAUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUAUUUAAUCAUUUUAAGUUGGUCAACGUUUGAGAGUUCAAAAGAUUUAGCAAUUUUAUACGAGUGAAAUUGAAAUCUCUUCAACUUUCAGACGUUUUCUGAUUUAUUAGCAAGGUAAAAAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UUAUUUAAUCAUUUUAA--| UG UC C A AG UUAUA GU G AACGUUUGAGAGUU AA AGAUUU CAAUU C UA C UUGCAGACUUUCAA UU UCUAAA GUUAA G GAAAAAUGGAACGAUUAUU^ GU UU C C -- AGUGA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cel-Mir-792_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020351 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGAGAGUUCAAAAGAUUUAGCAAUU -25
Get sequence
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| Mature sequence | Cel-Mir-792_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0004227 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UUGAAAUCUCUUCAACUUUCAGA -62
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004227 TargetScanWorm: cel-miR-792 |
