MirGeneDB ID | Cel-Mir-255 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-255 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cel-mir-255 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cbr-Mir-255 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (ce11) |
chrV: 5440663-5440721 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AACUGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUUCUUCAGUGGUUCGACUAAAUUUUGGAGGUAAGAAAUCUUUGUAGUUCUCCGUAUUGUGACGUGAAAACUGAAGAGAUUUUUUACAGACUUCACAAAUUUGAAAUAUAUUCCUGCAAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 AUUCUUCAGUGGUUCGACUA - ---| G C CGUAUU AAUUU UGGAG GUAAGAAAUCUUU UAGUU UC \ UUAAA ACUUC CAUUUUUUAGAGA GUCAA AG G AACGUCCUUAUAUAAAGU-- C AGA^ A A UGCAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cel-Mir-255_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0020341 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GUAAGAAAUCUUUGUAGUUCUC -22
Get sequence
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Mature sequence | Cel-Mir-255_3p |
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mirBase accession | MIMAT0004216 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AAACUGAAGAGAUUUUUUACAG -59
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004216 TargetScanWorm: cel-miR-255 |