| MirGeneDB ID | Bla-Mir-129-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-129 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | European lancelet (Branchiostoma lanceolatum) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Bla-Mir-129-P8a Bla-Mir-129-P8b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bfl-Mir-129-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Branchiostoma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Chordata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (BraLan2) |
Sc0000180: 389285-389344 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUUUUUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGACUGUGUACACCACUCGGCGUGCCCUGUCCUUUUUGUGGUUUGGGGCUUUUGAGAUCUCGACAGAAAAGCCCUUACCUCAAAAGGGAUAGGGUUCUGCUGCAUGUAGCGACAUAUACAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CGACUGUGUACACCACU- U-| U UU GAGAUC CGGCG GCCCUGUCCUUUUUG GGU GGGGCUUUU \ GUCGU UGGGAUAGGGAAAAC CCA UCCCGAAAA U ACAUAUACAGCGAUGUAC CU^ U U- GACAGC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Bla-Mir-129-P7_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUUUUUGUGGUUUGGGGCUUUU -23
Get sequence
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| Star sequence | Bla-Mir-129-P7_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- AAGCCCUUACCUCAAAAGGGAU -60
Get sequence
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