| MirGeneDB ID | Bfl-Mir-2071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2071 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Florida lancelet (Branchiostoma floridae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | bfl-mir-2071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bla-Mir-2071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Branchiostoma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Branchiostoma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_000003815.2_Bfl_VNyyK_genomic) |
NC_049982.1: 18526440-18526501 [+] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUGUUAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AACCACGGCCCCAUUCUCCGCAGGUUGAAUAUGCGGUGCGGUGGUAGCAACCGUCCCGACGUAAAGUCGAUUGUUACACCGCGCCGCAAAAGUUGACCUGGCGGCCUAUAACAACCAACAGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AACCACGGCCCCAUUCU- - UG AUA-| G C UCCCGA CCG CAGGU A UGCGGUGCGGUG UAGCAA CG C GGC GUCCA U ACGCCGCGCCAC AUUGUU GC G CGACAACCAACAAUAUCC G GU GAAA^ - A UGAAAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Bfl-Mir-2071_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0019172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUGCGGUGCGGUGGUAGCAACCG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Bfl-Mir-2071_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0009999 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AUUGUUACACCGCGCCGCAAAAG -62
Get sequence
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