MirGeneDB ID | Asp-Mir-2037 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2037 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Deep-sea anemone (Actinernus sp.) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Nve-Mir-2037 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Anenthemonae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Anenthemonae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_030867875.1_CUHK_Acti_1.0_genomic) |
JAOWCC010001634.1: 127539685-127539738 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GUGAUUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGAUGAGGAAGUUGUGUUCUUAGAAACUGUGAUGGAAGUCCUCCAAACACCCUCUUUAGAAGUGUGAUUGGAGACUUUUAUCGUAGUCUGAGAGCAAUUAUCAACAGCCAGAUCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GGAUGAGGAAGUUGUGU----| AA C A CCUCUU UCUUAGA CUGUGAUGGAAGUC UCCAA CAC \ AGAGUCU GAUGCUAUUUUCAG AGGUU GUG U CUAGACCGACAACUAUUAACG^ -- - A UGAAGA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Asp-Mir-2037_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GAUGGAAGUCCUCCAAACACC -21
Get sequence
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Mature sequence | Asp-Mir-2037_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
32- UGUGAUUGGAGACUUUUAUCGU -54
Get sequence
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