MirGeneDB ID | Asp-Mir-2026-P1a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2026 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Deep-sea anemone (Actinernus sp.) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Asp-Mir-2026-P1b Asp-Mir-2026-P2-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Nve-Mir-2026 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Actinernus sp. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Anenthemonae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_030867875.1_CUHK_Acti_1.0_genomic) |
JAOWCC010000577.1: 179450658-179450708 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2026-P1a) |
Mir-2026-P1a
JAOWCC010000577.1: 179450658-179450708 [-]
Ensembl
Mir-2026-P1b JAOWCC010000577.1: 179457293-179457343 [-] Ensembl |
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Seed | AAUCAGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGACAGGGAAUAAGUUUCUGAGUCCCUCCACUUCAAAUAUCUACUGAUGGAAUUUAAUUCAAUCAGUGGAUAUUUGAAAUUGUGGGUCCCAGACUAUGCCGAGGAACAACGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 UGACAGGGAAUAAGUUU--| AGU UCCAC G UU CUG CCC UUCAAAUAUCUACUGAU GAA \ GAC GGG AAGUUUAUAGGUGACUA CUU U GCAACAAGGAGCCGUAUCA^ CCU UGUUA A AA . 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Asp-Mir-2026-P1a_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUUCAAAUAUCUACUGAUGGAA -22
Get sequence
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Mature sequence | Asp-Mir-2026-P1a_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
29- CAAUCAGUGGAUAUUUGAAAUU -51
Get sequence
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