MirGeneDB ID | Aae-Mir-11899-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-11899 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Yellow fever mosquito (Aedes aegypti) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | aae-mir-11899-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Aae-Mir-11899-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | A. aegypti | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | A. aegypti | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Aaeg_L3) |
supercont1.1446: 67711-67773 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUGUAUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCCUUAUGUAGGCCAUUUUUUCUACUGUUCCAUGUAUGAUUUCGGUCAUGUAUGCAGUUGAAAAUAAUUAUAUGACCGAUUUAAUAUAUGGCUCAGUGGUUAUGAAAAAUCAUCAAACCCAAAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 CCCUUAUGUAGGCCAUUUUUU---| UU GAUU UGCAGUU CUACUG CCAUGUAU UCGGUCAUGUA G GGUGAC GGUAUAUA AGCCAGUAUAU A AAACCCAAACUACUAAAAAGUAUU^ UC AUUU UAAUAAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Aae-Mir-11899-P2_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAUGUAUGAUUUCGGUCAUGUA -22
Get sequence
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Star sequence | Aae-Mir-11899-P2_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0045998 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- UAUGACCGAUUUAAUAUAUGGCU -63
Get sequence
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