| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Em | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-142-P2a1 V | None | MIR-142 | AUAAAGU | None | None | NC_030726.1 | 41884054 | 41884113 | + | X. laevis | Vertebrata | 4 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-142-P2a2 V | None | MIR-142 | AUAAAGU | None | None | NC_030726.1 | 41885024 | 41885083 | + | X. laevis | Vertebrata | 4 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-142-P2b1 V | xla-mir-142 | MIR-142 | AUAAAGU | MIMAT0011139 | None | NC_030727.1 | 31425406 | 31425465 | + | X. laevis | Vertebrata | 4 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-142-P2b2 V | xla-mir-142-2 | MIR-142 | AUAAAGU | MIMAT0046454 | MIMAT0046455 | NC_030727.1 | 31426969 | 31427028 | + | X. laevis | Vertebrata | 4 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
