| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Eg | Em | Em | He | Ki | Re | St | St | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-8-P1a1 | None | MIR-8 | AAUACUG | None | None | NC_030736.1 | 81491532 | 81491591 | - | X. laevis | Nephrozoa | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-8-P1a2 | xla-mir-200b | MIR-8 | AAUACUG | MIMAT0046520 | MIMAT0046521 | NC_030737.1 | 57399626 | 57399685 | - | X. laevis | Nephrozoa | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-8-P3a1 | xla-mir-429 | MIR-8 | AAUACUG | None | MIMAT0001346 | NC_030736.1 | 81487076 | 81487134 | - | X. laevis | Nephrozoa | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-8-P3a2 | None | MIR-8 | AAUACUG | None | None | NC_030737.1 | 57394676 | 57394734 | - | X. laevis | Nephrozoa | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
