| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Sp | Sp | Sp | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tni-Mir-10-P1b1 V | tni-mir-10b-2 | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0002964 | None | 2 | 13424290 | 13424351 | - | Clupeocephala | Eumetazoa | 2 | Unknown | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tni-Mir-10-P1b2 | tni-mir-10d | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0003772 | None | 17 | 9715801 | 9715864 | + | Clupeocephala | Eumetazoa | Unknown | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tni-Mir-10-P1c1 V | tni-mir-10c | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0003088 | None | Un_random | 5507315 | 5507380 | - | Clupeocephala | Eumetazoa | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tni-Mir-10-P1c2 V | None | MIR-10 | ACCCUGU | None | None | 2 | 1745676 | 1745738 | - | Clupeocephala | Eumetazoa | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tni-Mir-10-P1d1 V | tni-mir-10b-1 | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0002964 | None | 9 | 4255306 | 4255366 | + | Clupeocephala | Eumetazoa | 2 | Unknown | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
