Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Fe | Fe | Fe | Fe | Ma | Ma | Ma | Ma | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tgu-Mir-17-P1a | tgu-mir-17a | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0017390 | MIMAT0014564 | 1 | 71703517 | 71703577 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tgu-Mir-17-P1c | tgu-mir-106 | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0014590 | MIMAT0027016 | 4A | 6773566 | 6773623 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tgu-Mir-17-P4a | tgu-mir-20a | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0014553 | MIMAT0026998 | 1 | 71703973 | 71704031 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tgu-Mir-17-P4c | tgu-mir-20b | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0014591 | MIMAT0027017 | 4A | 6773912 | 6773972 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all