Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Ad | Ea | Em | Em | Em | Em | Em | Fe | Fe | Fe | Fe | Oo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tca-Mir-9-P9b V | tca-mir-9d | MIR-9 | UAAAGCU | MIMAT0018748 | MIMAT0018749 | LG5 | 7455728 | 7455787 | + | T. castaneum | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tca-Mir-9-P12 | tca-mir-9b | MIR-9 | UUUGGUA | MIMAT0019134 | MIMAT0019135 | KQ972687 | 113154 | 113211 | - | Neoptera | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tca-Mir-3893 | tca-mir-3893 | MIR-3893 | UAAAGCU | MIMAT0018888 | MIMAT0018889 | LG5 | 7457235 | 7457292 | + | T. castaneum | T. castaneum | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all