Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Ad | Ea | Em | Em | Em | Em | Em | Fe | Fe | Fe | Fe | Oo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tca-Mir-3851-P2 | tca-mir-3851i | MIR-3851 | AGUACGG | MIMAT0045534 | MIMAT0045535 | LG6 | 272921 | 272978 | - | T. castaneum | T. castaneum | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tca-Mir-3851-P1 | tca-mir-3851h | MIR-3851 | AGUACGG | MIMAT0045530 | MIMAT0045531 | LG6 | 9956963 | 9957020 | - | T. castaneum | T. castaneum | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tca-Mir-3841 | tca-mir-3841 | MIR-3841 | AGUACGG | MIMAT0018726 | MIMAT0018727 | LG3 | 15689576 | 15689634 | + | T. castaneum | T. castaneum | No | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all