Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Bo | Br | He | Ki | Li | Ly | Pa | Sk | Sp | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-130-P1a | None | MIR-130 | AGUGCAA | None | None | Mir-130-P1b>1 | 104 | 161 | - | Gnathostomata | Vertebrata | Yes | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-130-P1b | sha-mir-130b | MIR-130 | AGUGCAA | None | MIMAT0022814 | GL856812.1 | 2852996 | 2853058 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-130-P1c | sha-mir-130a | MIR-130 | AGUGCAA | None | MIMAT0022830 | GL864900.1 | 1865398 | 1865459 | + | Gnathostomata | Vertebrata | Yes | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-130-P2b | None | MIR-130 | AGUGCAA | None | None | GL856812.1 | 2853994 | 2854055 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-130-P3b | sha-mir-454 | MIR-130 | AGUGCAA | None | MIMAT0022815 | GL856812.1 | 2872514 | 2872578 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sha-Mir-130-P4a | None | MIR-130 | AGUGCAA | None | None | GL841680.1 | 146016 | 146072 | - | Gnathostomata | Vertebrata | Yes |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all