| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Bo | Br | He | Ki | Li | Ly | Pa | Sk | Sp | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sha-Mir-199-P3 V | sha-mir-199a | MIR-199 | CAGUAGU | None | MIMAT0022785 | GL841403.1 | 248965 | 249027 | + | Gnathostomata | Vertebrata | 3 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sha-Mir-199-P2 V | None | MIR-199 | CAGUAGU | None | None | GL838915.1 | 7112 | 7172 | - | Gnathostomata | Vertebrata | 3 | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sha-Mir-199-P1 V | None | MIR-199 | CAGUAGU | None | None | GL856751.1 | 2995432 | 2995492 | - | Gnathostomata | Vertebrata | 3 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
