Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | Gu | He | Ki | La | Li | Mo | Mu | Sk | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-26-o1 | pma-mir-26a-1 | MIR-26 | UCAAGUA | MIMAT0019408 | MIMAT0019409 | NC_046072.1 | 10549245 | 10549307 | - | P. marinus | Vertebrata | Unknown | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-26-o2 | pma-mir-26a-2 | MIR-26 | UCAAGUA | MIMAT0019408 | MIMAT0019410 | NC_046070.1 | 25665244 | 25665301 | + | P. marinus | Vertebrata | Unknown | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-26-o3 | pma-mir-26b | MIR-26 | UCAAGUA | MIMAT0019411 | MIMAT0019412 | NC_046102.1 | 6813097 | 6813157 | + | P. marinus | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-26-o4 | None | MIR-26 | UCAAGUA | None | None | NC_046078.1 | 15629166 | 15629223 | + | P. marinus | Vertebrata | No | 1 | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all