| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | Gu | He | Ki | La | Li | Mo | Mu | Sk | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-190-o1 | pma-mir-190a | MIR-190 | GAUAUGU | MIMAT0019494 | None | NC_046069.1 | 19690194 | 19690256 | - | P. marinus | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-190-o2 | pma-mir-190b | MIR-190 | GAUAUGU | MIMAT0019495 | MIMAT0019496 | NC_046081.1 | 12047776 | 12047834 | + | P. marinus | Bilateria | Unknown | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-190-o3 | None | MIR-190 | GAUAUGU | None | None | NC_046125.1 | 1050359 | 1050420 | + | P. marinus | Bilateria | Unknown | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
