Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | 24 | 24 | 24 | 24 | 24 | 36 | 36 | 36 | 36 | 36 | 48 | 48 | 48 | 48 | 48 | 6d | 6d | 6d | 6d | 72 | 72 | 72 | 72 | 72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pdu-Mir-96-P3 | None | MIR-96 | AUGGCAC | None | None | JAPTHN010000007.1 | 11760214 | 11760273 | - | Bilateria | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pdu-Mir-96-P2 | None | MIR-96 | UUGGCAC | None | None | JAPTHN010000011.1 | 45340967 | 45341027 | - | Bilateria | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pdu-Mir-96-P1x | None | MIR-96 | UUUGGCA | None | None | JAPTHN010000039.1 | 3780734 | 3780790 | - | P. dumerilii | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pdu-Mir-96-P1w | None | MIR-96 | UUUGGCA | None | None | JAPTHN010000039.1 | 3782469 | 3782528 | - | P. dumerilii | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pdu-Mir-96-P1v | None | MIR-96 | UUGGCAC | None | None | JAPTHN010000001.1 | 165849565 | 165849622 | - | P. dumerilii | Bilateria | No | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all