Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pbv-Mir-124-P4b V | pbv-mir-124a-3 | MIR-124 | AAGGCAC | MIMAT0038913 | MIMAT0038914 | KE955369.1 | 120833 | 120892 | + | P. bivittatus | Bilateria | 2 | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pbv-Mir-124-P4a | None | MIR-124 | AAGGCAC | None | None | KE955369.1 | 120652 | 120711 | + | P. bivittatus | Bilateria | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pbv-Mir-124-P3 V | pbv-mir-124a-2 | MIR-124 | AAGGCAC | MIMAT0038913 | MIMAT0038914 | KE954357.1 | 247519 | 247578 | + | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pbv-Mir-124-P2 V | pbv-mir-124b | MIR-124 | AAGGCAC | MIMAT0038911 | MIMAT0038912 | KE954490.1 | 31653 | 31713 | - | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pbv-Mir-124-P1 V | pbv-mir-124a-1 | MIR-124 | AAGGCAC | MIMAT0038913 | MIMAT0038914 | KE957509.1 | 32637 | 32695 | - | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all