| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | He | Ki | Te | To | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ocu-Mir-130-P1c | ocu-mir-130a | MIR-130 | AGUGCAA | MIMAT0048217 | MIMAT0048218 | chr1 | 190714203 | 190714264 | + | Gnathostomata | Vertebrata | Yes | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ocu-Mir-130-P2a | ocu-mir-301b | MIR-130 | AGUGCAA | MIMAT0048366 | MIMAT0048367 | chr21 | 5522622 | 5522681 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ocu-Mir-130-P2b | ocu-mir-301a | MIR-130 | AGUGCAA | MIMAT0048364 | MIMAT0048365 | chr19 | 29153384 | 29153445 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ocu-Mir-130-P4a | ocu-mir-130b | MIR-130 | AGUGCAA | MIMAT0048219 | MIMAT0048220 | chr21 | 5522961 | 5523020 | + | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
