Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Ce | Fi | Li | Mi | Mi | Mi | Mi | Mi | Ov | Se | Se | Te | Te | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Neu-Mir-10-P1b V | None | MIR-10 | ACCCUGU | None | None | CM051817.1 | 238710335 | 238710396 | + | Gnathostomata | Eumetazoa | 2 | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Neu-Mir-10-P1c V | None | MIR-10 | ACCCUGU | None | None | CM051814.1 | 352452187 | 352452251 | + | Gnathostomata | Eumetazoa | 2 | Unknown | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Neu-Mir-10-P2b | None | MIR-10 | ACCCGUA | None | None | CM051817.1 | 25078557 | 25078616 | + | Gnathostomata | Eumetazoa | Yes | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Neu-Mir-10-P2c | None | MIR-10 | ACCCGUA | None | None | CM051817.1 | 411528185 | 411528243 | + | Gnathostomata | Eumetazoa | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Neu-Mir-10-P2d | None | MIR-10 | ACCCGUA | None | None | CM051817.1 | 275552886 | 275552942 | + | Gnathostomata | Eumetazoa | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Neu-Mir-10-P3c | None | MIR-10 | CCCUGAG | None | None | CM051817.1 | 411601168 | 411601229 | + | Gnathostomata | Eumetazoa | Unknown | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Neu-Mir-10-P3d | None | MIR-10 | CCCUGAG | None | None | CM051817.1 | 411601168 | 411601227 | + | Gnathostomata | Eumetazoa | Yes | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all