Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Ge | Ge | So | So | So | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lpo-Mir-1-P17 | None | MIR-1 | GGAAUGU | None | None | NW_013672612.1 | 33992 | 34051 | - | L. polyphemus | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lpo-Mir-1-P16 | None | MIR-1 | GGAAUGU | None | None | NW_013670974.1 | 27794 | 27854 | - | L. polyphemus | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lpo-Mir-1-P15 | None | MIR-1 | GGAAUGU | None | None | NW_013665643.1 | 814640 | 814699 | - | L. polyphemus | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lpo-Mir-1-P14 | None | MIR-1 | GGAAUGU | None | None | NW_013666779.1 | 103930 | 103990 | + | L. polyphemus | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lpo-Mir-1-P13 | None | MIR-1 | GGAAUGU | None | None | NW_013666362.1 | 150600 | 150660 | - | L. polyphemus | Bilateria | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all