Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | He | In | Li | Sk | Sp | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-1-P1 | gmo-mir-1-2 | MIR-1 | GGAAUGU | MIMAT0044247 | MIMAT0044042 | GeneScaffold_377 | 378532 | 378593 | + | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-1-P2a | gmo-mir-206 | MIR-1 | GGAAUGU | MIMAT0044198 | MIMAT0044199 | GeneScaffold_2491 | 51191 | 51250 | + | Clupeocephala | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-1-P3 | gmo-mir-1-1 | MIR-1 | GGAAUGU | MIMAT0044041 | MIMAT0044042 | contig374994 | 157 | 217 | - | Gnathostomata | Bilateria | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all