| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | He | In | Li | Sk | Sp | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-221-P2a2 | gmo-mir-221-2 | MIR-221 | GCUACAU | MIMAT0044021 | MIMAT0044022 | contig307202 | 158 | 220 | - | Clupeocephala | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-221-P2a1 | gmo-mir-221-1 | MIR-221 | GCUACAU | MIMAT0044032 | MIMAT0044022 | contig337589 | 767 | 830 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-221-P1a2 | gmo-mir-222-1 | MIR-221 | GCUACAU | MIMAT0044326 | MIMAT0044031 | scaffold00071 | 21723 | 21784 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gmo-Mir-221-P1a1 | gmo-mir-222-2 | MIR-221 | GCUACAU | MIMAT0044030 | MIMAT0044031 | contig337589 | 317 | 378 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
