Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | He | In | Li | Sk | Sp | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-132-P2b | gmo-mir-212-2 | MIR-132 | AACAGUC | MIMAT0046034 | MIMAT0044280 | GeneScaffold_4327 | 47133 | 47199 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-132-P2a | gmo-mir-212-2 | MIR-132 | CCUUGGC | MIMAT0046034 | MIMAT0044280 | GeneScaffold_1511 | 205676 | 205746 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-132-P1b | gmo-mir-132-2 | MIR-132 | CCGUGGC | MIMAT0044281 | MIMAT0044122 | GeneScaffold_4327 | 47489 | 47550 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-132-P1a | gmo-mir-132-1 | MIR-132 | AACAGUC | MIMAT0044121 | MIMAT0044122 | GeneScaffold_1511 | 205965 | 206027 | + | Clupeocephala | Vertebrata | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all