Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | He | In | Li | Sk | Sp | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-10-P3b1 | gmo-mir-125a-2 | MIR-10 | CCCUGAG | MIMAT0044194 | None | GeneScaffold_2454 | 123228 | 123283 | - | Clupeocephala | Eumetazoa | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-10-P3b2 | gmo-mir-125a-1 | MIR-10 | CCCUGAG | MIMAT0044194 | MIMAT0044314 | GeneScaffold_802 | 167620 | 167677 | - | Clupeocephala | Eumetazoa | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-10-P3c2 | gmo-mir-125b-2 | MIR-10 | CCCUGAG | MIMAT0044093 | MIMAT0044273 | GeneScaffold_4232 | 169613 | 169675 | + | Clupeocephala | Eumetazoa | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-10-P3d1 | gmo-mir-125b-1 | MIR-10 | CCCUGAG | MIMAT0044093 | None | GeneScaffold_1068 | 137441 | 137502 | + | Clupeocephala | Eumetazoa | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gmo-Mir-10-P3d2 | None | MIR-10 | CCCUGAG | None | None | GeneScaffold_4254 | 252790 | 252851 | - | Clupeocephala | Eumetazoa | No | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all