Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Br | Em | Ey | Gu | Gu | He | Li | Li | Ov | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-10-P1d1 V | dre-mir-10b-2 | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0001268 | MIMAT0031934 | chr23 | 36130016 | 36130078 | + | Clupeocephala | Eumetazoa | 2 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-10-P1c2 V | dre-mir-10a | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0001267 | MIMAT0003391 | chr12 | 27134886 | 27134944 | + | Clupeocephala | Eumetazoa | 2 | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-10-P1c1 V | dre-mir-10c | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0001770 | MIMAT0031935 | chr3 | 23720666 | 23720728 | + | Clupeocephala | Eumetazoa | 2 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-10-P1b2 V | dre-mir-10d | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0001771 | MIMAT0003394 | chr6 | 10867051 | 10867112 | + | Clupeocephala | Eumetazoa | 2 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-10-P1b1 V | dre-mir-10b-1 | MIR-10 | ACCCUGU | MIMAT0001268 | MIMAT0031919 | chr9 | 1952963 | 1953024 | - | Clupeocephala | Eumetazoa | 2 | No | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all