Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Br | Em | Ey | Gu | Gu | He | Li | Li | Ov | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-10-P2d2 | dre-mir-100-2 | MIR-10 | ACCCGUA | MIMAT0001813 | MIMAT0031958 | chr5 | 29990157 | 29990213 | + | Clupeocephala | Eumetazoa | No | 1 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-10-P2d1 | dre-mir-100-1 | MIR-10 | ACCCGUA | MIMAT0001813 | MIMAT0031957 | chr15 | 21437656 | 21437712 | + | Clupeocephala | Eumetazoa | No | 1 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-10-P2c2 | dre-mir-99-2 | MIR-10 | ACCCGUA | MIMAT0001812 | None | chr10 | 38074322 | 38074380 | - | Clupeocephala | Eumetazoa | Yes | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-10-P2c1 | dre-mir-99-1 | MIR-10 | ACCCGUA | MIMAT0001812 | None | chr15 | 29795596 | 29795654 | + | Clupeocephala | Eumetazoa | Yes |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all