| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Br | Em | Ey | Gu | Gu | He | Li | Li | Ov | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-199-P3 V | dre-mir-199-3 | MIR-199 | CAGUAGU | MIMAT0001277 | MIMAT0031922 | chr3 | 47195159 | 47195219 | - | Gnathostomata | Vertebrata | 3 | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-199-P2b V | None | MIR-199 | CAGUAGU | None | None | chr5 | 63709623 | 63709683 | - | Clupeocephala | Vertebrata | 3 | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-199-P2a V | dre-mir-199-2 | MIR-199 | CAGUAGU | MIMAT0001277 | MIMAT0003155 | chr5 | 1376779 | 1376839 | - | Clupeocephala | Vertebrata | 3 | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dre-Mir-199-P1a V | dre-mir-199-1 | MIR-199 | CAGUAGU | MIMAT0001277 | MIMAT0003155 | chr20 | 14875474 | 14875534 | + | Clupeocephala | Vertebrata | 3 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
