Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Br | Em | Ey | Gu | Gu | He | Li | Li | Ov | Te | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-1-P1 | dre-mir-1-2 | MIR-1 | GGAAUGU | None | MIMAT0001768 | chr2 | 4116326 | 4116387 | - | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-1-P2a | dre-mir-206-1 | MIR-1 | GGAAUGU | MIMAT0031988 | MIMAT0001866 | chr20 | 19544667 | 19544726 | - | Clupeocephala | Bilateria | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-1-P2b | dre-mir-206-2 | MIR-1 | GGAAUGU | None | MIMAT0001866 | chr17 | 5967262 | 5967321 | - | Clupeocephala | Bilateria | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dre-Mir-1-P3 | dre-mir-1-1 | MIR-1 | GGAAUGU | None | MIMAT0001768 | chr23 | 7210180 | 7210240 | - | Gnathostomata | Bilateria | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all