Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dpu-Mir-10-P1 V | dpu-mir-10 | MIR-10 | CCCUGUA | MIMAT0012636 | None | DAPPUscaffold_7 | 304826 | 304884 | - | Bilateria | Eumetazoa | 2 | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dpu-Mir-10-P2 | dpu-mir-100 | MIR-10 | ACCCGUA | MIMAT0012637 | None | DAPPUscaffold_71 | 446641 | 446720 | - | Bilateria | Eumetazoa | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dpu-Mir-10-P3 | None | MIR-10 | CCCUGAG | None | None | DAPPUscaffold_71 | 445364 | 445427 | - | Bilateria | Eumetazoa | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Dpu-Mir-10-P4 | dpu-mir-993 | MIR-10 | AAGCUCG | None | MIMAT0012676 | DAPPUscaffold_7 | 282318 | 282382 | + | Protostomia | Eumetazoa | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all