| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Bl | Bl | Bl | Bl | Oo | Oo | Oo | Oo | To | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpo-Mir-133-P1 V | cpo-mir-133a-2 | MIR-133 | UUGGUCC | MIMAT0046986 | MIMAT0046987 | scaffold_14 | 40575096 | 40575155 | + | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpo-Mir-133-P2 V | cpo-mir-133b | MIR-133 | UUGGUCC | MIMAT0046988 | MIMAT0046989 | scaffold_12 | 49862235 | 49862293 | + | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpo-Mir-133-P3 V | cpo-mir-133a-1 | MIR-133 | UUGGUCC | MIMAT0046986 | MIMAT0046987 | scaffold_119 | 1561210 | 1561269 | - | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
