Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Bl | Bl | Bl | Bl | Oo | Oo | Oo | Oo | To | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cpo-Mir-8-P1a | cpo-mir-200b | MIR-8 | AAUACUG | MIMAT0047091 | MIMAT0047092 | scaffold_186 | 1150409 | 1150467 | - | Vertebrata | Nephrozoa | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cpo-Mir-8-P1b | cpo-mir-200c | MIR-8 | AAUACUG | MIMAT0047093 | MIMAT0047094 | scaffold_107 | 310458 | 310518 | - | Vertebrata | Nephrozoa | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cpo-Mir-8-P3a | cpo-mir-429 | MIR-8 | AAUACUG | MIMAT0047247 | MIMAT0047248 | scaffold_186 | 1148974 | 1149032 | - | Vertebrata | Nephrozoa | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all