Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Bl | Bl | Bl | Bl | Oo | Oo | Oo | Oo | To | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cpo-Mir-29-P1b V | cpo-mir-29b-1 | MIR-29 | AGCACCA | MIMAT0046898 | MIMAT0046899 | scaffold_44 | 12025789 | 12025852 | + | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cpo-Mir-29-P1d V | cpo-mir-29b-2 | MIR-29 | AGCACCA | MIMAT0046900 | MIMAT0046899 | scaffold_12 | 15329413 | 15329477 | + | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cpo-Mir-29-P2b | cpo-mir-29a | MIR-29 | AGCACCA | MIMAT0046896 | MIMAT0046897 | scaffold_44 | 12026143 | 12026202 | + | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cpo-Mir-29-P2d | cpo-mir-29c | MIR-29 | AGCACCA | MIMAT0046901 | MIMAT0046902 | scaffold_12 | 15329893 | 15329950 | + | Gnathostomata | Bilateria | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all