| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Bl | Bl | Bl | Bl | Oo | Oo | Oo | Oo | To | Wh | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpo-Mir-199-P3 V | cpo-mir-199-1 | MIR-199 | CAGUAGU | MIMAT0047086 | MIMAT0047087 | scaffold_226 | 180917 | 180979 | - | Gnathostomata | Vertebrata | 3 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpo-Mir-199-P2 V | cpo-mir-199-3 | MIR-199 | CAGUAGU | MIMAT0047088 | MIMAT0047087 | scaffold_27 | 3923324 | 3923384 | + | Gnathostomata | Vertebrata | 3 | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpo-Mir-199-P1 V | cpo-mir-199-2 | MIR-199 | CAGUAGU | MIMAT0047086 | MIMAT0047087 | scaffold_12 | 11462616 | 11462676 | + | Gnathostomata | Vertebrata | 3 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
