| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Te | Te | Te | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpi-Mir-196-P1 | cpi-mir-196-3 | MIR-196 | AGGUAGU | MIMAT0037815 | None | JH584682 | 644036 | 644094 | - | Gnathostomata | Olfactores | Unknown | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpi-Mir-196-P3 | cpi-mir-196-1 | MIR-196 | AGGUAGU | MIMAT0037815 | MIMAT0037816 | JH584731 | 2484790 | 2484849 | - | Gnathostomata | Olfactores | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cpi-Mir-196-P4 | cpi-mir-196-2 | MIR-196 | AGGUAGU | MIMAT0037815 | MIMAT0037817 | JH584844 | 1085528 | 1085585 | - | Gnathostomata | Olfactores | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
