Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Li | Mi | Ov | Pe | Te | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-133-P1 V | cli-mir-133a-1 | MIR-133 | UUGGUCC | MIMAT0038509 | MIMAT0038510 | scaffold23 | 295639 | 295698 | - | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-133-P2 V | cli-mir-133b | MIR-133 | UUGGUCC | MIMAT0038511 | MIMAT0038512 | scaffold119 | 6659 | 6717 | + | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-133-P3 V | cli-mir-133a-2 | MIR-133 | UUGGUCC | MIMAT0038509 | MIMAT0038510 | scaffold36 | 3119758 | 3119817 | - | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-133-P4 V | None | MIR-133 | UUGGUCC | None | None | scaffold391 | 950891 | 950948 | - | Gnathostomata | Bilateria | 2 | No | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all